Протеомоснованная персонифицированная противоопухолевая клеточная терапия
Областью научных интересов нашей команды является многолетнее изучение возможности применения взрослых стволовых клеток (СК) в нейроонкологии, а также разработка и создание протеом-основанных персонифицированных противоопухолевых клеточных препаратов (ППОКП) и систем с заданными свойствами, для использования в комплексном лечении глиальных опухолей головного мозга и метастазов в головной мозг (ГМ) рака молочной железы (РМЖ) и рака легких (РЛ). В течение 7 лет мы изучали клеточные и молекулярные механизмы миграции, хоуминга, клеточной адгезии и патотропизм взрослых СК к опухолевым клеткам (ОК) in vitro и in vivo. Мы провели сравнительное протеомное картирование белков (ПКБ) и полнотранскриптомное профилирование экспрессии генов (ПТПЭГ) нейральных СК (СD 133+), выделенных из обонятельной выстилки носа онкологического пациента, мобилизованных аутологичных гемопоэтических (СD34+) СК и раковых (СD 133+) СК (РСК), выделенных из глиальных опухолей ГМ ( мультиформных глиобластом линии U87 и линии U251) человека и животных (глиома линии С6 крыс), а также биоинформационную обработку и математическое моделирование полученных результатов. Мы показали глобальные структурные протеомные и транскриптомные отличия изученных взрослых СК между собой.
Установлен ряд фундаментальных научных фактов, которые позволили разработать новаторскую платформу персонифицированного циторегуляторного воздействия на репродуктивные и пролиферативные функции опухолевых СК (ОСК) опухоли заданными секретомами аутологичных СК с модифицированным ПТПЭГ.
- Мы доказали в эксперименте, что СК пациента «всегда» придут в опухоль в ГМ, найдут ОК и ОСК и прилипнут к ним и будут оказывать на них слабое регуляторное воздействие по механизму by stander effect,
- Низкая эффективность противоопухолевого регуляторного и контролирующего воздействия СК на ОК и ОСК обусловлена системными механизмам видообразования в канцерогенезе, которые могут быть преодолены путем заданной модификации эффекторных свойств этих СК, основанной на результатах ПКБ и ПТПЭГ.
- Показано, что в протеоме ОСК можно картировать определенное (от 30 до 60%) количество видоспецифичных белков, биоинформационный анализ которых позволяет выявить в РСК внутриклеточные пути сигнальной трансдукции (ВКПСТ), не пострадавшие в результате канцерогенной неопластической трансформации и доступные для таргетного регуляторного воздействия.
- Управление и контроль за пролиферативными и репродуктивными функциями РСК опухоли можно реализовать путем воздействиям на известные мембранные белки-мишени этих ВКПСТ в ОСК.
- Существующие базы данных белок–белковых взаимодействий позволяют определить основные белки–лиганды, которые при взаимодействии с мембранными белками –мишенями этих ВКПСТ и способны активировать их в ОСК и управлять эффекторными функциями ОСК.
- Применение способов химической индукции позволяет модифицировать транскриптомные профили СК пациента в заданном направлении без генно-инженерных манипуляций и создать клеточный препарат из собственных СК, секретирующих требуемые регуляторные белки – лиганды.
- Разработано специальное программное обеспечение для ПЭВМ для поиска в базах данных транскриптомов компании Affymetrix (UK) пертурбогенов ( химических веществ и микроРНК), способных изменить ПТПЭГ СК в заданном направлении и определить условия и время необходимое для требуемой модификации ПТПЭГ СК пациента.
В эксперименте на моделях опухоли мозга у крыс была показана эффективность предложенной циторегуляторной терапии клеточными системами с модифицированным ПТПЭГ в подавлении репродуктивных и пролиферативных свойств ОК и ОСК опухоли мозга. Показана роль и место предложенного циторегуляторного метода противоопухолевого лечения в комплексной конвенциональной (циторедуктивной, цитотоксической, цитотоксической) и иммунной терапии опухолей мозга. Предложена новая парадигма системной протеом-основанной противоопухолевой терапии, направленная не на полное уничтожение ОК и ОСК, а на перевод острого фатального злокачественного онкологического процесса в хроническое не смертельное заболевание человека и животных путем контроля количества ОК и регуляции ОСК. В настоящее время данная технология оформлена заявкой на патент РФ, получены разрешения Ученых Советов и Этических комитетов Российского ракового центра РАН и Федерального медико-биологического агентства России на проведение клинических испытаний. Проект зарегистрирован на www.clinicaltrail.gov. ( NCT01782287 for Proteome-based Immunotherapy of Lung Cancer Brain Metastases http://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT01782287?term=NCT01782287&rank=1, NCT01782274 for Proteome –based Immunotherapy of Brain Metastases from Breast Cancer http://clinicaltrials.gov/ct2/results?term =NCT01782274+&Search=Search NCT01759810 for Proteome-based Personalized Immunotherapy of Glioblastoma,http://clinicaltrials.gov/ct2/results?term=NCT01759810+&Search=Search).
Предварительные результаты протеом - основанной терапии различных типов рака.
Представляем полученную нами цифровую информацию о результатах протеом-основанной терапии рака в виде табличного материала (9 таблиц).
Таблица 1.
Распределение больных с различными онкологическими заболеваниями 3-4 стадии на контрольные группы и опытные группы, получавших прецизионную протеом-основанную иммунотерапию
№ п/п |
Онкологические заболевания по нозологическим подгруппам |
Количество и/болезни |
Количество пациентов в опытной группе |
Контрольная группа |
---|---|---|---|---|
1. |
Рак легких |
81 |
10 |
21 |
2. |
Рак молочной железы |
63 |
10 |
13 |
3. |
Мультиформная глиобластома. |
72 |
11 |
12 |
4. |
Рак почки |
20 |
5 |
10 |
5. |
Рак матки и яичников |
35 |
7 |
10 |
6. |
Саркома мягких тканей |
38 |
5 |
10 |
7. |
Рак желудка |
29 |
5 |
10 |
8. |
Колоректальный рак |
39 |
6 |
10 |
9. |
Опухоли головы и шеи |
16 |
3 |
7 |
10. |
Меланома |
45 |
8 |
10 |
11. |
Итого:
|
438 |
70 |
113 |
Таблица 2.
Распределение больных с онкологическими заболеваниями 3-4 стадии по возрасту и полу в контрольных группах
№ п/п |
Онкологические заболевания по нозологическим подгруппам
|
Количество больных |
Пол
мужжен |
Возраст
мужжен |
1. |
Рак легких |
21 |
14 7 |
56,564,6 |
2. |
Рак молочной железы |
13 |
-13 |
- 54,7 |
3. |
Мультиформная глиобластома. |
12 |
8 4 |
64,763,5 |
4. |
Рак почки |
10 |
5 5 |
62,663,5 |
5. |
Рак матки и яичников |
10 |
- 10 |
-48,5 |
6. |
Саркома мягких тканей |
10 |
7 3 |
48,6 54,8 |
7. |
Рак желудка |
10 |
10 - |
66,2 - |
8. |
Колоректальный рак |
10 |
8 2 |
56,2 51,2 |
9. |
Опухоли головы и шеи |
7 |
2 5 |
49,1 60,2 |
10 |
Меланома |
10 |
8 2 |
56,4 60,1 |
11. |
Итого: |
113 |
6251 |
57,3 57,9 |
Таблица 3.
Распределение больных с онкологическими заболеваниями 3-4 стадии по возрасту и полу в опытных группах
Таблица 4
Распределениеонкологическихбольных контрольных группс метастатическимпоражением головного мозга по степени компенсациипо шкале Karnofsky/ ECOG
№ п/п |
Онкологические заболевания по нозологическим подгруппам
|
Количество Больных |
Пол
мужжен |
Возраст
мужжен |
1. |
Рак легких |
10 |
8 2 |
64,163,3 |
2. |
Рак молочной железы |
10 |
-10 |
- 52,7 |
3. |
Мультиформная глиобластома. |
11 |
74 |
36,158,5 |
4. |
Рак почки |
5 |
5- |
55,6- |
5. |
Рак матки и яичников |
7 |
-7 |
-52,1 |
6. |
Саркома мягких тканей |
5 |
4 1 |
56,2 44 |
7. |
Рак желудка |
5 |
4 1 |
56,2 61 |
8. |
Колоректальный рак |
6 |
3 3 |
54,3 51,8 |
9. |
Опухоли головы и шеи |
3 |
3 - |
44,3- |
10 |
Меланома |
8 |
6 2 |
46,2 48,5 |
11. |
Итого: |
70 |
40 30 |
51,6 53,9 |
Таблица 5
Распределениеонкологическихбольных опытных группс метастатическимпоражением головного мозга по степени компенсациипо шкале Karnofskу/ ECOG
Шкала Karnofskу/ шкала ECOG (в % / в баллах) |
Число больных с раком молочной железы с МТС в головной мозг абс % |
Число больных с раком легкого сМТС в головноймозг абс % |
Число больных с мультиформной глиобластомой головного мозга абс % |
90 / 1 |
- - |
1 10 |
19.1 |
80 / 1 |
1 10 |
110 |
218.1 |
70 / 2 |
2 20 |
220 |
218.1 |
60 / 2 |
4 40 |
330 |
19.1 |
50 / 3 |
2 20 |
110 |
19.1 |
40 / 3 |
1 10 |
110 |
218.1 |
20-30/4 |
-- |
110 |
218.1 |
Таблица 6.
Распределение больных с онкологическими заболеваниями 3-4 стадии в зависимости от применения стратегий иммунотерапии
№ п/п |
Онкологические заболевания по нозологическим подгруппам
|
Стратегия протеом-основанной адоптивной ИТ(ДВ и ЦТЛ) абс% |
Стратегия применения протеом-основанных таргетных БМКП абс% |
Стратегия комбиниро-ванного клеточно- лека-рственного ремоделиро-вания противоопухоле-вой функции иммуни-тета (прецизионная ИТ) абс% |
1. |
Рак легких |
10 14.3 |
10 33.3 |
8 16 |
2. |
Рак молочной железы |
10 14.3 |
723.3 |
7 14 |
3. |
Мультиформная глиобластома. |
11 15.8 |
1033.3 |
8 16 |
4. |
Рак почки |
5 7.2 |
-- |
24 |
5. |
Рак матки и яичников |
7 10 |
-- |
36 |
6. |
Саркома мягких тканей |
5 7.1 |
-- |
36 |
7. |
Рак желудка |
5 7.1 |
-- |
48 |
8. |
Колоректальный рак |
6 8.5 |
26.7 |
5 10 |
9. |
Опухоли головы и шеи |
3 4.2 |
13.4 |
24 |
10 |
Меланома |
811.4 |
- - |
8 16 |
11. |
Итого: |
70100 |
30 100 |
50100 |
Таблица 7.
Эффективностьпротивоопухолевойиммунотерапии при различных онкологических заболеваниях 3-4 стадии
№ п/п |
Онкологические забо-левания по нозоло-гическим подгруппам
|
Ухудшение
абс% |
Нет эффекта абс% |
Эффективна
абс% |
Высоко эффективна абс% |
1. |
Рак легких |
1 25 |
2 10.5 |
5 18.5 |
1 25 |
2. |
Рак молочной железы |
125 |
1 5.3 |
3 11.1 |
3 75 |
3. |
Мультиформная глиобластома. |
2 50 |
3 15.7 |
5 18.5 |
-- |
4. |
Рак почки |
-- |
1 5.3 |
13.7 |
-- |
5. |
Рак матки и яичников |
-- |
1 5.3 |
27.4 |
-- |
6. |
Саркома мягких тканей |
-- |
1 5.3 |
27.4 |
-- |
7. |
Рак желудка |
-- |
2 10.5 |
27.4 |
-- |
8. |
Колоректальный рак |
-- |
2 10.5 |
3 11.1 |
-- |
9. |
Опухоли головы и шеи |
-- |
2 10.5 |
- - |
-- |
10. |
Меланома |
-- |
4 21 |
4 14.8 |
-- |
11. |
Итого: |
- 100 |
19100 |
27100 |
4 100 |
Таблица 8.
Длительность жизни различных больных с раком легких и раком молочной железы с метастазами в головной мозг и глиобластомой в исследуемых опытных группах
№ п/п |
Онкологические заболевания по нозологическим подгруппам
|
Время жизни больных с момента диагностики новообразования до смерти (контрольная группа)
Месяцы |
Время жизни бо-льных домомента появления опухо-левого очага в ГМ (контрольная группа) Месяцы |
Время жизни боль-ных с момента диаг-ностики новообра-зования до смерти (опытные группы)
месяцы |
Время жизни бо-льных домоме-нта появления опухолевого очага в ГМ (опытные группы) Месяцы |
1. |
Рак легких |
10.6 |
6,1 |
11.2 |
12,6 |
2. |
Рак молочной железы |
45.7 |
2.25 |
59,6 |
8,7 |
3. |
Мультиформная глиобластома. |
12,3 |
5,2 |
36 |
12,6 |
4. |
Итого: |
22.8 |
4,51 |
35,6 |
11,3 |
Таблица 9
Безопасность применения прецизионной иммунотерапиирака и других злокачественных новообразований
№ п/п |
Онкологические заболевания по нозологическим подгруппам |
Без осложнений
абс% |
Минималь- ные осложнения
абс% |
Побочные эффекты Средней тяжести абс% |
Тяжелые (витальные) осложнения
абс% |
1. |
Рак легких |
6 15.3 |
222.2 |
133,3 |
- |
2. |
Рак молочной железы |
7 17.9 |
- |
133,3 |
- |
3. |
Мультиформная глиобластома. |
5 12.9 |
333.3 |
- |
2 100 |
4. |
Рак почки |
25.1 |
|||
5. |
Рак матки и яичников |
37.6 |
|||
6. |
Саркома мягких тканей |
37.6 |
|||
7. |
Рак желудка |
410.2 |
- |
- |
|
8. |
Колоректальный рак |
25.1 |
1 11.1 |
133,3 |
|
9. |
Опухоли головы и шеи |
25.1 |
|||
10. |
Меланома |
512.9 |
3 33.3 |
- |
- |
11. |
Итого: |
39 100 |
9 100 |
3 100 |
2 100 |